Record Details

Klasifikasi Amfibi di Asia Tenggara dengan Penjajaran Sekuen DNA Menggunakan Algoritme Genetika

Jurnal Pengembangan Teknologi Informasi dan Ilmu Komputer

View Archive Info
 
 
Field Value
 
ISSN 2548-964X
 
Authentication Code dc
 
Title Statement Klasifikasi Amfibi di Asia Tenggara dengan Penjajaran Sekuen DNA Menggunakan Algoritme Genetika
 
Added Entry - Uncontrolled Name Emilia, Yunita Kristanti
Widodo, Agus Wahyu
Rahman, Muh. Arif
Fakultas Ilmu Komputer, Universitas Brawijaya
Fakultas Ilmu Komputer, Universitas Brawijaya
Fakultas Ilmu Komputer, Universitas Brawijaya
 
Summary, etc. Analisis sekuen DNA merupakan hal utama dalam proses klasifikasi amfibi pada tingkat family. Salah satu metode dalam analisis sekuen yaitu penjajaran sekuen namun memerlukan waktu dan biaya yang besar. Masalah penambahan gap dan berapa panjang gap juga menjadi permasalahan pada penjajaran sekuen. Proses klasifikasi amfibi menggunakan algoritme genetika untuk penyisipan gap dengan beberapa modifikasi pada setiap tahapnya agar susunan DNA tidak berubah. Penelitian ini menggunakan two cut point crossover dan reciprocal exchange mutation. Skor fitness digunakan untuk proses klasifikasi yaitu dengan menghitung proporsi kemudian convert ke nilai evolutionary distance. Data yang digunakan yaitu 363 DNA amfibi dengan gen 16s rRNA yang dibagi dalam lima family yaitu Bufonidae, Dicroglossidae, Megophyridae, Ranidae, Rhacophoridae. Pengujian akurasi sistem menggunakan parameter crossover rate=0.7, mutation rate=0.3, popsize=700, jumlah generasi=900, dan faktor pengali=1.2. Pengujian akurasi sistem pada lima family dilakukan masing-masing 10 kali dan mendapatkan rata-rata akurasi 94%. Dengan rata-rata akurasi sistem tersebut, maka algoritme genetika mampu melakukan proses penjajaran sekuen untuk klasifikasi amfibi.
 
Publication, Distribution, Etc. Fakultas Ilmu Komputer (FILKOM), Universitas Brawijaya
 
Electronic Location and Access application/pdf
http://j-ptiik.ub.ac.id/index.php/j-ptiik/article/view/8613
 
Data Source Entry Jurnal Pengembangan Teknologi Informasi dan Ilmu Komputer; Vol 5 No 2 (2021): Februari 2021
 
Language Note ind
 
Terms Governing Use and Reproduction Note Hak Cipta (c) 2021 Jurnal Pengembangan Teknologi Informasi dan Ilmu Komputer
 


www.freevisitorcounters.com